23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1360 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1360  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  487  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2613  hypothetical protein  64.08 
 
 
246 aa  295  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.178744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4103  hypothetical protein  54.62 
 
 
238 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.706455  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5014  hypothetical protein  45.75 
 
 
242 aa  209  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13552  hypothetical protein  47.76 
 
 
236 aa  208  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00218816  hitchhiker  0.00000199189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4720  hypothetical protein  45.75 
 
 
242 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4632  hypothetical protein  45.75 
 
 
242 aa  208  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1540  hypothetical protein  45.75 
 
 
254 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5218  hypothetical protein  43.55 
 
 
246 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3725  hypothetical protein  45.87 
 
 
254 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1252  hypothetical protein  29.53 
 
 
318 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1868  hypothetical protein  25.88 
 
 
294 aa  54.7  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3314  hypothetical protein  31.9 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  27.12 
 
 
795 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1698  hypothetical protein  29.8 
 
 
304 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3745  hypothetical protein  29.9 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2527  Acetoacetate decarboxylase  28.1 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11656  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5682  hypothetical protein  26.39 
 
 
305 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6046  hypothetical protein  26.39 
 
 
305 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6532  hypothetical protein  26.76 
 
 
305 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  0.079973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2823  hypothetical protein  25.81 
 
 
304 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7477  hypothetical protein  34.34 
 
 
305 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0744  Acetoacetate decarboxylase  27.52 
 
 
219 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>