27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3725 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3725  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1360  hypothetical protein  45.45 
 
 		 245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4103  hypothetical protein  44.58 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.706455  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4632  hypothetical protein  42.8 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.883432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4720  hypothetical protein  42.8 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5014  hypothetical protein  42.39 
 
 		 242 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13552  hypothetical protein  43.57 
 
 		 236 aa  168  9e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00218816  hitchhiker  0.00000199189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1540  hypothetical protein  41.04 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.711067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5218  hypothetical protein  40.62 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2613  hypothetical protein  38.8 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.178744 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1252  hypothetical protein  26.58 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2527  Acetoacetate decarboxylase  27.9 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11656  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2991  hypothetical protein  26.8 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.25392  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2701  hypothetical protein  26.94 
 
 		 308 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0744  Acetoacetate decarboxylase  27.67 
 
 		 219 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1868  hypothetical protein  26.24 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2823  hypothetical protein  27.92 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3314  hypothetical protein  32.69 
 
 		 260 aa  49.7  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1698  hypothetical protein  28.11 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.10247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6532  hypothetical protein  29.03 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal  0.079973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3745  hypothetical protein  32.74 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4673  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3220  hypothetical protein  25 
 
 		 350 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.111198  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6046  hypothetical protein  32.63 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5682  hypothetical protein  32.63 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7477  hypothetical protein  32.63 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3919  acetoacetate decarboxylase  27.64 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>