12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0489 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0489  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  229  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0218  hypothetical protein  63.55 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4833  hypothetical protein  53 
 
 		 105 aa  72  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4299  TadE-like  40.35 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25260  TadE-like protein  41.82 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4035  hypothetical protein  46.9 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.753634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1978  hypothetical protein  54.43 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5866  mucin-associated surface protein (MASP)  41.12 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.787168  normal  0.227787 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35880  hypothetical protein  42.34 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.49985  normal  0.306805 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3885  hypothetical protein  38.32 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0280  hypothetical protein  37.21 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0124  hypothetical protein  44.92 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00673106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>