24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0691 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0691  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  634    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0661  hypothetical protein  72.78 
 
 
320 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0682  hypothetical protein  73.1 
 
 
320 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3695  hypothetical protein  72.15 
 
 
320 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0692  hypothetical protein  72.47 
 
 
320 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0735  hypothetical protein  66.35 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1104  hypothetical protein  26.52 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.262219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2528  hypothetical protein  27.66 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0857848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1799  hypothetical protein  30.95 
 
 
338 aa  67  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.325402  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5741  hypothetical protein  22.22 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2190  hypothetical protein  23.21 
 
 
341 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000157839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5392  hypothetical protein  26.16 
 
 
313 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0198899  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4324  hypothetical protein  26.77 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.882448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4234  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  27.66 
 
 
480 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0877604  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2612  hypothetical protein  22.07 
 
 
333 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00101149  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2536  hypothetical protein  23.08 
 
 
336 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.394827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2858  hypothetical protein  23 
 
 
336 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000712374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2816  hypothetical protein  22.65 
 
 
333 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95302  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2474  hypothetical protein  23.1 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2818  hypothetical protein  24.36 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000668438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2811  hypothetical protein  24.36 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.289301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1534  hypothetical protein  28 
 
 
329 aa  45.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2620  hypothetical protein  24.36 
 
 
336 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0497543  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2569  hypothetical protein  24 
 
 
336 aa  43.5  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000714525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>