25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0735 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0735  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0661  hypothetical protein  77.81 
 
 
320 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0682  hypothetical protein  77.5 
 
 
320 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3695  hypothetical protein  77.19 
 
 
320 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0692  hypothetical protein  77.19 
 
 
320 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0691  hypothetical protein  66.35 
 
 
312 aa  427  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.253682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1104  hypothetical protein  25.63 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.262219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1799  hypothetical protein  24.76 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.325402  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2612  hypothetical protein  24.04 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00101149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2190  hypothetical protein  24.83 
 
 
341 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000157839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2536  hypothetical protein  20.71 
 
 
336 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.394827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2474  hypothetical protein  22.81 
 
 
333 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.466533  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5741  hypothetical protein  24.87 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1534  hypothetical protein  26.09 
 
 
329 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.272473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2858  hypothetical protein  20.91 
 
 
336 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000712374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2816  hypothetical protein  22.05 
 
 
333 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95302  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2528  hypothetical protein  25.93 
 
 
336 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0857848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2620  hypothetical protein  22.16 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0497543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2818  hypothetical protein  22.16 
 
 
336 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000668438 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2811  hypothetical protein  22.16 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.289301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5392  hypothetical protein  27.49 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0198899  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2569  hypothetical protein  21.87 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000714525  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4324  hypothetical protein  26.47 
 
 
340 aa  53.1  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.882448  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4234  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  35.38 
 
 
480 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0877604  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0495  hypothetical protein  23.86 
 
 
326 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>