12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3382 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3382  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  752    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.394336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2299  hypothetical protein  40.98 
 
 
386 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733107  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4932  hypothetical protein  29.57 
 
 
375 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334332 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4931  hypothetical protein  25.29 
 
 
389 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.339017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5997  hypothetical protein  25.43 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0336447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3255  hypothetical protein  27.22 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54416  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3383  hypothetical protein  25.07 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1983  hypothetical protein  27.11 
 
 
365 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2298  hypothetical protein  22.5 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02760  hypothetical protein  28.53 
 
 
1010 aa  57  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.585729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2870  hypothetical protein  22.22 
 
 
382 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3913  hypothetical protein  24.05 
 
 
330 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>