24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0340 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0340  cell division FtsK/SpoIIIE  100 
 
 
726 aa  1470    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6258  hypothetical protein  49.45 
 
 
708 aa  625  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256332  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5592  hypothetical protein  31.7 
 
 
752 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2871  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.99 
 
 
681 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.457557  normal  0.0575931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1215  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.11 
 
 
455 aa  60.1  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00586249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.6 
 
 
558 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.67 
 
 
2947 aa  54.3  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5859  DNA segregation ATPase  28.43 
 
 
388 aa  54.3  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5659  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.98 
 
 
388 aa  52.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255861  normal  0.0102641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.57 
 
 
1336 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0195217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04110  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  28.79 
 
 
1360 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5950  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.41 
 
 
1124 aa  49.3  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8101  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  27.21 
 
 
1327 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331826  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0946  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.33 
 
 
895 aa  48.9  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.245862  normal  0.321731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0997  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.33 
 
 
895 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0991  cell division FtsK/SpoIIIE  27.62 
 
 
1340 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0157  cell division FtsK/SpoIIIE  27.46 
 
 
800 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410924  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1438  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.44 
 
 
1278 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229363  normal  0.229746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13484  hypothetical protein  26.94 
 
 
1236 aa  45.8  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00886198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.08 
 
 
1318 aa  45.8  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770518  decreased coverage  0.00818473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 
1229 aa  45.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 
1229 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.51 
 
 
1229 aa  45.8  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.11 
 
 
1349 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>