12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5051 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_5051  conjugal transfer protein TraC  100 
 
 		 98 aa  189  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5394  conjugal transfer protein TraC  100 
 
 		 98 aa  189  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9188  conjugal transfer protein Dtr system  64.29 
 
 		 125 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5515  TraC family protein  65.31 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7063  conjugal transfer protein Dtr system  62.24 
 
 		 98 aa  107  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8049  conjugal transfer protein TraC  64.84 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8130  conjugal transfer protein TraC  64.84 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.852257  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4674  conjugal transfer protein TraC  61.86 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6102  hypothetical protein  50.85 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9593  conjugal transfer protein Dtr system  46.67 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219001  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5574  hypothetical protein  42.59 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0726083  normal  0.0249071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0649  TraC family protein  36.51 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>