13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_8049 on replicon NC_011982
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011982  Avi_8049  conjugal transfer protein TraC  100 
 
 		 98 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8130  conjugal transfer protein TraC  100 
 
 		 98 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.852257  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9188  conjugal transfer protein Dtr system  79.07 
 
 		 125 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7063  conjugal transfer protein Dtr system  66.33 
 
 		 98 aa  118  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5051  conjugal transfer protein TraC  64.84 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5394  conjugal transfer protein TraC  64.84 
 
 		 98 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4674  conjugal transfer protein TraC  78.69 
 
 		 86 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5515  TraC family protein  56.12 
 
 		 98 aa  97.1  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6102  hypothetical protein  42.67 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9593  conjugal transfer protein Dtr system  41.94 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219001  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5574  hypothetical protein  46.43 
 
 		 92 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0726083  normal  0.0249071 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0649  TraC family protein  37.35 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5002  TraC family protein  42.86 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>