12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5574 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5574  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0726083  normal  0.0249071 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6102  hypothetical protein  47.25 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7063  conjugal transfer protein Dtr system  47.54 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8049  conjugal transfer protein TraC  46.43 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8130  conjugal transfer protein TraC  46.43 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.852257  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5515  TraC family protein  39.34 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.675845  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9188  conjugal transfer protein Dtr system  35 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4674  conjugal transfer protein TraC  40.74 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5051  conjugal transfer protein TraC  42.59 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5394  conjugal transfer protein TraC  42.59 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9593  conjugal transfer protein Dtr system  40.98 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219001  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0371  traC protein  37.1 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.250572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>