9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2689 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2689  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 122 aa  247  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.461565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3603  outer membrane lipoprotein  75.49 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3301  outer membrane lipoprotein  75.25 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3710  outer membrane lipoprotein  63.64 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1502  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4265  lipoprotein Omp10  57.94 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0077  lipoprotein Omp10  69.41 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0072  lipoprotein Omp10  69.41 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0915362  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2726  outer membrane lipoprotein  45.37 
 
 		 118 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0336  putative lipoprotein  36.75 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>