9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0077 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0077  lipoprotein Omp10  100 
 
 
126 aa  257  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0072  lipoprotein Omp10  100 
 
 
126 aa  257  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0915362  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4265  lipoprotein Omp10  85.6 
 
 
126 aa  224  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2689  putative outer membrane lipoprotein  69.41 
 
 
122 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.461565 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3710  outer membrane lipoprotein  53.23 
 
 
130 aa  128  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3301  outer membrane lipoprotein  63.44 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.838106  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3603  outer membrane lipoprotein  63.44 
 
 
122 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0336  putative lipoprotein  47.58 
 
 
124 aa  117  6e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2726  outer membrane lipoprotein  45.98 
 
 
118 aa  89  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>