17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_R0055 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_R0055  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 107 bp  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0298861  normal  0.0925037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0047  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 107 bp  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00389628  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0006  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 107 bp  212  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00175  normal  0.724893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0029  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0044  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.043736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0039  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0236857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0034  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.139456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0032  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0905853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0026  5S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 111 bp  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0007  5S ribosomal RNA  92.68 
 
 		 107 bp  50.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0044  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 110 bp  46.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0012  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 108 bp  46.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0929617  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0007  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 108 bp  46.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0049  5S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 110 bp  46.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.660583  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0012  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 109 bp  44.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0007  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 109 bp  44.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0270163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0010  5S ribosomal RNA  86.96 
 
 		 113 bp  44.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>