14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5434 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5434  hypothetical protein  100 
 
 
94 aa  190  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5131  hypothetical protein  59.57 
 
 
108 aa  114  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1294  hypothetical protein  51.06 
 
 
109 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.886265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0925  hypothetical protein  43.88 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000524962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3710  hypothetical protein  47.87 
 
 
110 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1721  hypothetical protein  32.18 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3187  protein of unknown function DUF433  32.89 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180832  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1913  hypothetical protein  38.78 
 
 
112 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1506  hypothetical protein  35.29 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1031  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236248 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3672  hypothetical protein  37.21 
 
 
95 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243113  normal  0.808254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  34.78 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3187  hypothetical protein  30.59 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0181  hypothetical protein  36.73 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>