18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3710 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3710  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  221  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1294  hypothetical protein  51.92 
 
 
109 aa  105  3e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.886265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5434  hypothetical protein  47.87 
 
 
94 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5131  hypothetical protein  48.42 
 
 
108 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0925  hypothetical protein  42.74 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000524962  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1506  hypothetical protein  36 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1721  hypothetical protein  25.74 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1707  hypothetical protein  37.11 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1646  hypothetical protein, putative phage gene  40 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0804  hypothetical protein  36.05 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3603  hypothetical protein  34.72 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1031  hypothetical protein  31.31 
 
 
116 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0284  hypothetical protein  34.74 
 
 
112 aa  42.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04230  transcription repressor protein  37.11 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.611673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3171  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  38.33 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104102 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0652  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  37.14 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199942  normal  0.733298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1903  hypothetical protein  40.62 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.722874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0945  RelE-like cytotoxic translational repressor of toxin-antitoxin stability system  34.74 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000041771  hitchhiker  0.000000340827 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>