19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5113 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5113  protein of unknown function DUF1264  100 
 
 
253 aa  533  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1678  protein of unknown function DUF1264  59.92 
 
 
254 aa  324  8.000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.168425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1782  hypothetical protein  56.3 
 
 
261 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.388726  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1604  hypothetical protein  55.88 
 
 
261 aa  299  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1673  hypothetical protein  56.3 
 
 
261 aa  299  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1675  hypothetical protein  55.88 
 
 
261 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1738  hypothetical protein  55.88 
 
 
261 aa  298  6e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1863  hypothetical protein  57.32 
 
 
264 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3962  putative lipoprotein  57.32 
 
 
273 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.34998 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3771  protein of unknown function DUF1264  43.05 
 
 
256 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2260  hypothetical protein  46.35 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.130987  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0442  protein of unknown function DUF1264  49.48 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.112839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1425  hypothetical protein  45.95 
 
 
270 aa  199  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.562548  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25390  Protein of unknown function (DUF1264)  45.73 
 
 
236 aa  198  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.726243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2918  hypothetical protein  40.64 
 
 
267 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0313473  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07959  DUF1264 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12830)  40.2 
 
 
230 aa  167  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.878606  normal  0.168472 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00430  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.651391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1490  hypothetical protein  45.83 
 
 
125 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.626253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4623  hypothetical protein  45.83 
 
 
125 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>