16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  675    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  27.44 
 
 		 307 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  22.22 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  25.97 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  25 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  27.48 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  24.84 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  25.39 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  25.23 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  22.26 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  25.21 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  21.24 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  21.12 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  20.69 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0028  w0044  37.25 
 
 		 66 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  21.21 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>