20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0291 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3970  acyltransferase 3  92.17 
 
 
345 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4165  acyltransferase 3  92.17 
 
 
345 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4047  acyltransferase 3  91.88 
 
 
345 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3653  acyltransferase 3  99.42 
 
 
345 aa  693    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0291  acyltransferase 3  100 
 
 
345 aa  695    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  96.23 
 
 
345 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4078  acyltransferase 3  92.17 
 
 
345 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0320  hypothetical protein  91.04 
 
 
335 aa  628  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3675  acyltransferase 3  87.54 
 
 
345 aa  624  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3331  hypothetical protein  59.03 
 
 
349 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0102  acyltransferase 3  40.94 
 
 
368 aa  259  4e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248047  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1771  acyltransferase 3  36.26 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1158  acyltransferase 3  33.33 
 
 
385 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00977171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3659  hypothetical protein  31.37 
 
 
346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2178  acyltransferase domain, membrane protein  26.06 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1380  hypothetical protein  27.27 
 
 
321 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.786153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2797  acyltransferase 3  26.82 
 
 
363 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3838  acyltransferase 3  23.98 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1141  acyltransferase 3  24.65 
 
 
361 aa  48.5  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283735  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35600  hypothetical protein  28.22 
 
 
355 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110812  hitchhiker  0.00000141946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>