31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3838 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3838  acyltransferase 3  100 
 
 
347 aa  687    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  39.18 
 
 
349 aa  215  9e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1385  hypothetical protein  35.93 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0431733  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0999  acyltransferase 3  35.42 
 
 
339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2883  acyltransferase 3  36.28 
 
 
404 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2975  acyltransferase 3  35.82 
 
 
404 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4522  acyltransferase 3  34.04 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.236282  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1853  hypothetical protein  40.68 
 
 
197 aa  90.5  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1814  acyltransferase 3  26.24 
 
 
352 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3970  acyltransferase 3  23.14 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4078  acyltransferase 3  23.14 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4165  acyltransferase 3  23.14 
 
 
345 aa  56.6  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  21.14 
 
 
345 aa  55.8  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4047  acyltransferase 3  23.14 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3675  acyltransferase 3  23.75 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3653  acyltransferase 3  21.78 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0291  acyltransferase 3  23.98 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2655  acyltransferase 3  23.28 
 
 
361 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0104149  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0320  hypothetical protein  23.05 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1850  acyltransferase 3  27.63 
 
 
371 aa  47.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.889698  normal  0.0583172 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3659  hypothetical protein  21.9 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1630  acyltransferase 3  24.53 
 
 
350 aa  47.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3331  hypothetical protein  21.65 
 
 
349 aa  44.3  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3327  acyltransferase family protein  28.19 
 
 
435 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0144  acyltransferase family protein  28.19 
 
 
435 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.738138  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4014  putative acyltransferase  29.71 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3284  acyltransferase family protein  29.71 
 
 
473 aa  43.5  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3942  putative acyltransferase  29.71 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1558  acyltransferase family protein  29.71 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2979  acyltransferase family protein  29.71 
 
 
392 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0102  acyltransferase 3  26.7 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248047  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>