16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2578 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2578  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2645  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2753  hypothetical protein  98.6 
 
 
285 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1701  hypothetical protein  96.14 
 
 
285 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1510  hypothetical protein  95.44 
 
 
285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1546  hypothetical protein  95.44 
 
 
285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2836  hypothetical protein  95.44 
 
 
285 aa  570  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00562225  normal  0.416931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1519  hypothetical protein  95.09 
 
 
285 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1417  hypothetical protein  92.98 
 
 
287 aa  557  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0656  hypothetical protein  82.46 
 
 
285 aa  495  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0892738  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3563  hypothetical protein  80.7 
 
 
285 aa  496  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0985  hypothetical protein  76.14 
 
 
285 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0380637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0039  hypothetical protein  67.94 
 
 
292 aa  384  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104676  hitchhiker  0.000427768 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1019  hypothetical protein  50.88 
 
 
299 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0986  hypothetical protein  50.53 
 
 
299 aa  297  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0488  group-specific protein  27.13 
 
 
311 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>