15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3563 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3563  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  591  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2578  hypothetical protein  80.7 
 
 		 285 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2645  hypothetical protein  80.7 
 
 		 285 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1701  hypothetical protein  79.65 
 
 		 285 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2753  hypothetical protein  80.35 
 
 		 285 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1519  hypothetical protein  80.35 
 
 		 285 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1417  hypothetical protein  80 
 
 		 287 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1510  hypothetical protein  80.7 
 
 		 285 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1546  hypothetical protein  80.7 
 
 		 285 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2836  hypothetical protein  80.7 
 
 		 285 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00562225  normal  0.416931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0656  hypothetical protein  82.11 
 
 		 285 aa  489  1e-137  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0892738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0985  hypothetical protein  79.3 
 
 		 285 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0380637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0039  hypothetical protein  66.79 
 
 		 292 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.104676  hitchhiker  0.000427768 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0986  hypothetical protein  49.65 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1019  hypothetical protein  49.65 
 
 		 299 aa  299  4e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>