13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1848 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1848  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2735  hypothetical protein  42.39 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32280  hypothetical protein  41.85 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2429  hypothetical protein  35.16 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2498  hypothetical protein  34.62 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2233  hypothetical protein  32.97 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2397  hypothetical protein  32.97 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1512  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605177  hitchhiker  0.00146384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0464  hypothetical protein  35.24 
 
 		 112 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1640  Protein of unknown function DUF2314  35.79 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1513  hypothetical protein  46.43 
 
 		 72 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410392  hitchhiker  0.00136383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0330  hypothetical protein  30.21 
 
 		 111 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2634  hypothetical protein  29.2 
 
 		 331 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>