19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_32280 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_32280  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2735  hypothetical protein  98.05 
 
 
205 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1848  hypothetical protein  41.85 
 
 
217 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2429  hypothetical protein  35.64 
 
 
209 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0110308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2498  hypothetical protein  34.16 
 
 
209 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2233  hypothetical protein  33 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2397  hypothetical protein  33 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1512  hypothetical protein  51.69 
 
 
93 aa  97.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.605177  hitchhiker  0.00146384 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1513  hypothetical protein  54.29 
 
 
72 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.410392  hitchhiker  0.00136383 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2634  hypothetical protein  40 
 
 
331 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0464  hypothetical protein  34.69 
 
 
112 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1640  Protein of unknown function DUF2314  34.34 
 
 
97 aa  59.3  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0011  hypothetical protein  35.21 
 
 
143 aa  56.2  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0933  hypothetical protein  25.29 
 
 
110 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000877694  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0924  hypothetical protein  25.29 
 
 
116 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1088  hypothetical protein  24.14 
 
 
110 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.53157e-59 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0330  hypothetical protein  31.58 
 
 
111 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1095  hypothetical protein  30.49 
 
 
251 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0931  hypothetical protein  26.76 
 
 
114 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0008712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>