15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3777 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3777  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  835    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0079  hypothetical protein  44.71 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4275  hypothetical protein  44.47 
 
 		 436 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0076  hypothetical protein  44.23 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0074  hypothetical protein  44.23 
 
 		 436 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4861  hypothetical protein  41.46 
 
 		 428 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4187  hypothetical protein  43.36 
 
 		 434 aa  316  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3974  hypothetical protein  38.46 
 
 		 430 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0060  hypothetical protein  42.79 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0079  hypothetical protein  41.65 
 
 		 436 aa  298  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0074  hypothetical protein  43.94 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0077  hypothetical protein  41.65 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0075  hypothetical protein  41.65 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0071  hypothetical protein  35.1 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3572  hypothetical protein  31.77 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>