15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3974 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3974  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  847    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0079  hypothetical protein  44.34 
 
 		 436 aa  356  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0076  hypothetical protein  44.39 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0074  hypothetical protein  44.15 
 
 		 436 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4275  hypothetical protein  44.15 
 
 		 436 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0077  hypothetical protein  43.58 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0079  hypothetical protein  43.58 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0075  hypothetical protein  43.58 
 
 		 436 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0060  hypothetical protein  43.59 
 
 		 438 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0074  hypothetical protein  43.17 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3777  hypothetical protein  38.46 
 
 		 420 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4861  hypothetical protein  39.9 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4187  hypothetical protein  39.59 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0071  hypothetical protein  34.5 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3572  hypothetical protein  30.31 
 
 		 413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>