15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4861 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4861  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  843    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3777  hypothetical protein  41.46 
 
 
420 aa  319  7e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4187  hypothetical protein  43.78 
 
 
434 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0079  hypothetical protein  41.35 
 
 
436 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4275  hypothetical protein  40.62 
 
 
436 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.733034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0076  hypothetical protein  40.87 
 
 
436 aa  292  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0074  hypothetical protein  40.87 
 
 
436 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0074  hypothetical protein  43.17 
 
 
435 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3974  hypothetical protein  39.9 
 
 
430 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0079  hypothetical protein  39.81 
 
 
436 aa  273  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295361 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0077  hypothetical protein  39.81 
 
 
436 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0075  hypothetical protein  39.81 
 
 
436 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0060  hypothetical protein  39.9 
 
 
438 aa  253  6e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0071  hypothetical protein  32.35 
 
 
438 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3572  hypothetical protein  30.5 
 
 
413 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>