32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3075 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3075  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  209  7e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3990  hypothetical protein  78.5 
 
 		 109 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189568  normal  0.364321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3317  hypothetical protein  75.47 
 
 		 106 aa  159  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3691  hypothetical protein  77.78 
 
 		 99 aa  157  5e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3656  hypothetical protein  74.75 
 
 		 105 aa  153  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3223  hypothetical protein  73.47 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00463747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0891  hypothetical protein  72.73 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3131  hypothetical protein  72.73 
 
 		 105 aa  148  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00959511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0975  hypothetical protein  71.72 
 
 		 107 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2832  hypothetical protein  70.75 
 
 		 106 aa  144  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0152708  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0963  hypothetical protein  69 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379083  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3327  hypothetical protein  69 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1065  hypothetical protein  69 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000960688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1032  hypothetical protein  69 
 
 		 106 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0122538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3093  hypothetical protein  64.49 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18170  hypothetical protein  49.35 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18760  hypothetical protein  46.84 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506368  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0878  hypothetical protein  40.51 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206731  hitchhiker  0.000000513036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2411  hypothetical protein  41.11 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.850789  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1572  hypothetical protein  39.53 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120004  normal  0.637459 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0849  hypothetical protein  37.04 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.506643  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2053  hypothetical protein  39.53 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0593615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3688  hypothetical protein  39.53 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0827  hypothetical protein  36.71 
 
 		 118 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.098665  decreased coverage  0.00931795 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0175  hypothetical protein  39.77 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3297  hypothetical protein  38.46 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.23288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2958  hypothetical protein  32.14 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.4749 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2996  hypothetical protein  29.76 
 
 		 97 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0857  hypothetical protein  28.89 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3165  hypothetical protein  28.89 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3266  hypothetical protein  28.89 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>