32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2053 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0593615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3688  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  203  7e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1572  hypothetical protein  97.96 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120004  normal  0.637459 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0878  hypothetical protein  45.98 
 
 		 110 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206731  hitchhiker  0.000000513036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3266  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3165  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0857  hypothetical protein  42.53 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2996  hypothetical protein  41.57 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2958  hypothetical protein  41.57 
 
 		 121 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.4749 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0827  hypothetical protein  41.38 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.098665  decreased coverage  0.00931795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3699.1  hypothetical protein  40.45 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0849  hypothetical protein  40.23 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.506643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2411  hypothetical protein  46.43 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.850789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0175  hypothetical protein  41.86 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1065  hypothetical protein  45.35 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000960688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3327  hypothetical protein  45.35 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.224467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1032  hypothetical protein  45.35 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0122538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0963  hypothetical protein  45.35 
 
 		 106 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.379083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3656  hypothetical protein  45.35 
 
 		 105 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0975  hypothetical protein  44.19 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0539485  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3223  hypothetical protein  44.32 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00463747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3131  hypothetical protein  44.32 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00959511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0891  hypothetical protein  44.32 
 
 		 105 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3990  hypothetical protein  43.75 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.189568  normal  0.364321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3317  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281055  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3093  hypothetical protein  41.56 
 
 		 108 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2832  hypothetical protein  42.68 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0152708  normal  0.62617 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3075  hypothetical protein  39.53 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3691  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18170  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3297  hypothetical protein  30.34 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.23288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18760  hypothetical protein  31.82 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>