20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1087 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1087  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166557  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1183  hypothetical protein  84.13 
 
 		 61 aa  101  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0132866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1278  hypothetical protein  84.13 
 
 		 61 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000103837  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1072  hypothetical protein  73.02 
 
 		 61 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0911  hypothetical protein  70.97 
 
 		 61 aa  87.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3548  hypothetical protein  68.85 
 
 		 61 aa  85.5  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1143  hypothetical protein  68.25 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1042  hypothetical protein  68.25 
 
 		 61 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000202786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2969  hypothetical protein  68.85 
 
 		 61 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000152173  normal  0.333175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3051  hypothetical protein  68.85 
 
 		 61 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00180929  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3149  hypothetical protein  68.85 
 
 		 61 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194141  normal  0.914839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1047  hypothetical protein  67.21 
 
 		 61 aa  84.7  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3247  hypothetical protein  68.85 
 
 		 61 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617722  decreased coverage  0.000458947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1109  hypothetical protein  68.85 
 
 		 61 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2736  hypothetical protein  70.18 
 
 		 59 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2902  hypothetical protein  69.84 
 
 		 61 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.718841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03324  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0076557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004448  hypothetical protein  36.84 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0117676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2549  hypothetical protein  28.07 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1936  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>