20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03324 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03324  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0076557  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0609  hypothetical protein  57.41 
 
 		 56 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3548  hypothetical protein  45 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1047  hypothetical protein  45 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1072  hypothetical protein  49.15 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3051  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00180929  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3149  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194141  normal  0.914839 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2969  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000152173  normal  0.333175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1143  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0911  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1042  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000202786  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1109  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3247  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617722  decreased coverage  0.000458947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1087  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166557  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2736  hypothetical protein  47.27 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000017749  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1183  hypothetical protein  44.07 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0132866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1278  hypothetical protein  45.76 
 
 		 61 aa  48.1  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000103837  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004448  hypothetical protein  44.23 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0117676  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00947  hypothetical protein  42.31 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1936  hypothetical protein  43.4 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>