19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2736 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2736  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000017749  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2969  hypothetical protein  74.55 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000152173  normal  0.333175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3051  hypothetical protein  74.55 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00180929  normal  0.14335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3548  hypothetical protein  74.55 
 
 
61 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3149  hypothetical protein  74.55 
 
 
61 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194141  normal  0.914839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0911  hypothetical protein  74.55 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207511  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1143  hypothetical protein  74.55 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641007  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1042  hypothetical protein  74.55 
 
 
61 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000202786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1047  hypothetical protein  72.73 
 
 
61 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00105512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3247  hypothetical protein  72.73 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0617722  decreased coverage  0.000458947 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1109  hypothetical protein  72.73 
 
 
61 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138118  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1183  hypothetical protein  65.45 
 
 
61 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0132866  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1072  hypothetical protein  67.31 
 
 
61 aa  87  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1278  hypothetical protein  65.45 
 
 
61 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000103837  normal  0.0478806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1087  hypothetical protein  70.18 
 
 
63 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166557  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2902  hypothetical protein  76.36 
 
 
61 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.718841  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03324  hypothetical protein  47.27 
 
 
58 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0076557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1936  hypothetical protein  45.45 
 
 
77 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000951613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0678  hypothetical protein  54.05 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>