20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4262 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4262  ATP synthase F0, I subunit  100 
 
 		 41 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0815185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5175  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000733243  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4153  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000580419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4107  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000123417  normal  0.0706174 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4228  ATP synthase I chain  96.15 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03567  hypothetical protein  96.15 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000214026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4097  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 41 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167395  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4082  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 41 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00136612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4203  ATP synthase F0, I subunit  96.15 
 
 		 41 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.137943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4182  F0F1 ATP synthase subunit I  96.15 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000328591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  96.15 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000153619  normal  0.0333498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  96.15 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3955  F0F1 ATP synthase subunit I  96.15 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03623  F0F1 ATP synthase subunit I  96.15 
 
 		 126 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000273392  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  63.16 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  56.41 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  56.41 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  56.41 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  60.53 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4187  F0F1 ATP synthase subunit I  57.89 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000826403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>