More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3963 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02863  phosphate transporter  81.36 
 
 
499 aa  785    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485547  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03342  phosphate transporter, low-affinity  92.38 
 
 
499 aa  906    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0222  phosphate transporter  92.38 
 
 
499 aa  906    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0709  phosphate transporter  81.16 
 
 
499 aa  783    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03295  hypothetical protein  92.38 
 
 
499 aa  906    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4689  phosphate transporter  75.4 
 
 
500 aa  796    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4033  low-affinity inorganic phosphate transporter  73.9 
 
 
498 aa  757    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3167  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  81.16 
 
 
499 aa  784    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0122  phosphate transporter  73.9 
 
 
531 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361788  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3782  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  100 
 
 
498 aa  1005    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.675569  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4486  phosphate transporter  71.31 
 
 
501 aa  739    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4839  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  92.38 
 
 
499 aa  906    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4093  phosphate transporter  73.9 
 
 
498 aa  758    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0223  phosphate transporter  92.38 
 
 
499 aa  906    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3692  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  92.38 
 
 
499 aa  906    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3792  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  100 
 
 
498 aa  1005    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3963  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  100 
 
 
498 aa  1005    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3907  phosphate transporter  91.38 
 
 
499 aa  888    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3975  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  92.38 
 
 
499 aa  906    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0055  low-affinity inorganic phosphate transporter  64.31 
 
 
524 aa  660    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3930  phosphate transporter  71.15 
 
 
504 aa  746    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3454  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  81.16 
 
 
499 aa  784    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4117  phosphate transporter  72.31 
 
 
502 aa  741    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02812  hypothetical protein  81.36 
 
 
499 aa  785    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3829  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  92.38 
 
 
499 aa  906    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3902  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  100 
 
 
498 aa  1005    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4203  phosphate transporter  71.12 
 
 
501 aa  752    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0706  phosphate transporter  81.36 
 
 
499 aa  785    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720208  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3782  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  92.18 
 
 
499 aa  904    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3859  putative low-affinity inorganic phosphate transporter 2  100 
 
 
498 aa  1005    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0686997  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3272  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  81.16 
 
 
499 aa  783    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4299  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  79.37 
 
 
438 aa  627  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1373  phosphate transporter  53.82 
 
 
490 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4350  phosphate transporter  53.82 
 
 
497 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4441  phosphate transporter  53.61 
 
 
497 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375988  hitchhiker  0.000123098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55770  putative phosphate transporter  54.69 
 
 
489 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1262  phosphate transporter  53.63 
 
 
491 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4312  phosphate transporter family protein  54.23 
 
 
490 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4016  phosphate transporter  53.83 
 
 
490 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1013  phosphate transporter  53.61 
 
 
490 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000116864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4859  putative phosphate transporter  54.18 
 
 
489 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3607  phosphate transporter  51.01 
 
 
489 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.309683  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1052  low-affinity inorganic phosphate transporter  50.81 
 
 
489 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3409  phosphate transporter  51.21 
 
 
494 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0878  phosphate transporter  51.01 
 
 
489 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3484  phosphate transporter  51.01 
 
 
489 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3045  phosphate transporter  50.61 
 
 
489 aa  501  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330688  normal  0.118917 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0927  phosphate transporter  50.92 
 
 
489 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0892  phosphate transporter  50.81 
 
 
489 aa  500  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170136  normal  0.621096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10600  Phosphate transporter  53.86 
 
 
492 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3020  phosphate transporter  50.51 
 
 
489 aa  480  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2657  inorganic phosphate transporter  43.6 
 
 
542 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04880  Phosphate transporter  44.29 
 
 
536 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1637  phosphate transporter  43.38 
 
 
539 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265126  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3854  phosphate transporter  43 
 
 
529 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2689  phosphate transporter  44.1 
 
 
546 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2029  phosphate transporter family protein  42.06 
 
 
528 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3702  phosphate transporter family protein  43.78 
 
 
484 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1572  phosphate transporter family protein  42.06 
 
 
494 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2121  phosphate transporter family protein  42.06 
 
 
528 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0613  phosphate transporter family protein  42.06 
 
 
528 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4319  phosphate transporter  43.82 
 
 
537 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2208  phosphate transporter family protein  42.68 
 
 
528 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.757922  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3676  phosphate transporter  43.56 
 
 
538 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151212  hitchhiker  0.00000639982 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0709  phosphate transporter family protein  42.06 
 
 
528 aa  366  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3432  phosphate transporter  41.39 
 
 
544 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0245217  normal  0.231604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0807  phosphate transporter family protein  42.46 
 
 
528 aa  364  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.65234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1773  phosphate transporter  42.45 
 
 
538 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475806  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3244  phosphate transporter  43.51 
 
 
528 aa  363  4e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0357  phosphate transporter  42.36 
 
 
530 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.763168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5180  phosphate transporter  42.13 
 
 
530 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738193 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4732  phosphate transporter  42.31 
 
 
473 aa  359  5e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.84748  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1761  phosphate transporter  43.64 
 
 
538 aa  359  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05870  putative phosphate transporter  43.98 
 
 
540 aa  359  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.996994 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4305  phosphate transporter  44.03 
 
 
528 aa  358  9e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.323368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0552  putative phosphate transporter  42.71 
 
 
536 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4651  phosphate transporter  42.24 
 
 
530 aa  356  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5255  phosphate transporter  43.22 
 
 
546 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4788  phosphate transporter  42.23 
 
 
546 aa  354  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2559  phosphate transporter  43.22 
 
 
536 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.768412  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1005  phosphate transporter family protein  42.2 
 
 
543 aa  353  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4977  phosphate transporter  42.26 
 
 
530 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3076  phosphate transporter  42.26 
 
 
530 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5291  phosphate transporter  42.26 
 
 
530 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4985  phosphate transporter  41.2 
 
 
473 aa  352  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287414 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4103  phosphate transporter  42.14 
 
 
538 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348099  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0970  phosphate transporter  40.96 
 
 
529 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0274  phosphate transporter  40.85 
 
 
534 aa  350  5e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951775  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1668  phosphate transporter  41.51 
 
 
540 aa  346  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.336875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1071  phosphate transporter  41.12 
 
 
497 aa  346  5e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.454735  hitchhiker  0.000185026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3866  phosphate transporter  42.58 
 
 
542 aa  346  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860303 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5327  phosphate transporter  41.82 
 
 
534 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5331  phosphate transporter  41.04 
 
 
551 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899751  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3178  phosphate transporter  41.68 
 
 
533 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0323756  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3469  phosphate transporter  40.04 
 
 
533 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.866739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2692  phosphate transporter  37 
 
 
451 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.608667  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0331  phosphate transporter  47.71 
 
 
160 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  37.33 
 
 
385 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  35.81 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  36.7 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>