More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4319 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4103  phosphate transporter  78.25 
 
 
538 aa  789    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348099  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2559  phosphate transporter  68.79 
 
 
536 aa  696    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.768412  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3702  phosphate transporter family protein  84.5 
 
 
484 aa  840    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1773  phosphate transporter  79.66 
 
 
538 aa  877    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475806  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04880  Phosphate transporter  78.84 
 
 
536 aa  843    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4319  phosphate transporter  100 
 
 
537 aa  1073    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3676  phosphate transporter  78.85 
 
 
538 aa  828    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151212  hitchhiker  0.00000639982 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3432  phosphate transporter  63.2 
 
 
544 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0245217  normal  0.231604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1761  phosphate transporter  77.7 
 
 
538 aa  805    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165402 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1668  phosphate transporter  64.71 
 
 
540 aa  648    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.336875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0552  putative phosphate transporter  83.43 
 
 
536 aa  885    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0274  phosphate transporter  66.4 
 
 
534 aa  671    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951775  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05870  putative phosphate transporter  83.89 
 
 
540 aa  893    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.996994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1637  phosphate transporter  64.94 
 
 
539 aa  683    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265126  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3854  phosphate transporter  65.95 
 
 
529 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2657  inorganic phosphate transporter  70.99 
 
 
542 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2689  phosphate transporter  70.99 
 
 
546 aa  711    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4651  phosphate transporter  63 
 
 
530 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5180  phosphate transporter  62.81 
 
 
530 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0357  phosphate transporter  63.77 
 
 
530 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.763168 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4305  phosphate transporter  66.8 
 
 
528 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.323368 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0613  phosphate transporter family protein  68.01 
 
 
528 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2121  phosphate transporter family protein  68.01 
 
 
528 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2029  phosphate transporter family protein  68.01 
 
 
528 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0709  phosphate transporter family protein  68.01 
 
 
528 aa  622  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2208  phosphate transporter family protein  68.01 
 
 
528 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.757922  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1005  phosphate transporter family protein  64.12 
 
 
543 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1572  phosphate transporter family protein  68.01 
 
 
494 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0807  phosphate transporter family protein  66.95 
 
 
528 aa  616  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.65234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0970  phosphate transporter  62.69 
 
 
529 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3076  phosphate transporter  64.15 
 
 
530 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4977  phosphate transporter  64.15 
 
 
530 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5291  phosphate transporter  64.15 
 
 
530 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3244  phosphate transporter  64.89 
 
 
528 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5327  phosphate transporter  59.63 
 
 
534 aa  586  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3178  phosphate transporter  61.54 
 
 
533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0323756  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5255  phosphate transporter  60.81 
 
 
546 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4788  phosphate transporter  60.42 
 
 
546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3469  phosphate transporter  62.16 
 
 
533 aa  571  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.866739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3866  phosphate transporter  59.73 
 
 
542 aa  557  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5331  phosphate transporter  57.49 
 
 
551 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1071  phosphate transporter  53.8 
 
 
497 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.454735  hitchhiker  0.000185026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4985  phosphate transporter  49.07 
 
 
473 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4732  phosphate transporter  48.34 
 
 
473 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.84748  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1373  phosphate transporter  46.98 
 
 
490 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4441  phosphate transporter  47.7 
 
 
497 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375988  hitchhiker  0.000123098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4312  phosphate transporter family protein  47.45 
 
 
490 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4350  phosphate transporter  47.7 
 
 
497 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115393 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4016  phosphate transporter  47.02 
 
 
490 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1262  phosphate transporter  46.64 
 
 
491 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55770  putative phosphate transporter  47.15 
 
 
489 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4689  phosphate transporter  43.51 
 
 
500 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10600  Phosphate transporter  46.73 
 
 
492 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4203  phosphate transporter  44.81 
 
 
501 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4859  putative phosphate transporter  47.76 
 
 
489 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3930  phosphate transporter  44.02 
 
 
504 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03342  phosphate transporter, low-affinity  44.51 
 
 
499 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0222  phosphate transporter  44.51 
 
 
499 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3782  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  44.51 
 
 
499 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3975  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  44.51 
 
 
499 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3829  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  44.51 
 
 
499 aa  380  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03295  hypothetical protein  44.51 
 
 
499 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3692  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  44.51 
 
 
499 aa  379  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0223  phosphate transporter  44.51 
 
 
499 aa  379  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4839  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  44.51 
 
 
499 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3409  phosphate transporter  42.83 
 
 
494 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1013  phosphate transporter  46.98 
 
 
490 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000116864 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02863  phosphate transporter  42.62 
 
 
499 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1052  low-affinity inorganic phosphate transporter  42.89 
 
 
489 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3484  phosphate transporter  42.62 
 
 
489 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3454  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.62 
 
 
499 aa  372  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02812  hypothetical protein  42.62 
 
 
499 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3272  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.83 
 
 
499 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3045  phosphate transporter  43.42 
 
 
489 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330688  normal  0.118917 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0878  phosphate transporter  42.62 
 
 
489 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3167  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.62 
 
 
499 aa  372  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4117  phosphate transporter  44.51 
 
 
502 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3607  phosphate transporter  42.62 
 
 
489 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.309683  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0706  phosphate transporter  42.62 
 
 
499 aa  373  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720208  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0709  phosphate transporter  42.41 
 
 
499 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0927  phosphate transporter  42.71 
 
 
489 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3907  phosphate transporter  44.56 
 
 
499 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0892  phosphate transporter  42.74 
 
 
489 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170136  normal  0.621096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4486  phosphate transporter  44.81 
 
 
501 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3020  phosphate transporter  42.86 
 
 
489 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3792  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.67 
 
 
498 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3859  putative low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.67 
 
 
498 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0686997  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4033  low-affinity inorganic phosphate transporter  42.68 
 
 
498 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0122  phosphate transporter  42.68 
 
 
531 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4093  phosphate transporter  42.68 
 
 
498 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3963  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.67 
 
 
498 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3902  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.67 
 
 
498 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3782  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.67 
 
 
498 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.675569  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2692  phosphate transporter  43.1 
 
 
451 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.608667  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0055  low-affinity inorganic phosphate transporter  41.62 
 
 
524 aa  349  6e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4299  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  38.23 
 
 
438 aa  267  4e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0331  phosphate transporter  69.62 
 
 
160 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0184  putative phosphate permease  41.67 
 
 
363 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0688  phosphate transporter  37.44 
 
 
335 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000897538  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0703  phosphate transporter  37.44 
 
 
335 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000147408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>