More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2657 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1668  phosphate transporter  69.93 
 
 
540 aa  747    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.336875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4103  phosphate transporter  67.86 
 
 
538 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348099  normal  0.0644466 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3854  phosphate transporter  65.3 
 
 
529 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2689  phosphate transporter  85.42 
 
 
546 aa  906    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3702  phosphate transporter family protein  69.83 
 
 
484 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1761  phosphate transporter  68.06 
 
 
538 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165402 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1773  phosphate transporter  69.34 
 
 
538 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.475806  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1637  phosphate transporter  71.24 
 
 
539 aa  765    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.265126  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4319  phosphate transporter  70.99 
 
 
537 aa  731    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.162719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3676  phosphate transporter  66.92 
 
 
538 aa  691    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.151212  hitchhiker  0.00000639982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0552  putative phosphate transporter  69.83 
 
 
536 aa  715    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04880  Phosphate transporter  67.82 
 
 
536 aa  710    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05870  putative phosphate transporter  70.42 
 
 
540 aa  719    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.996994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2657  inorganic phosphate transporter  100 
 
 
542 aa  1083    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0274  phosphate transporter  68.39 
 
 
534 aa  694    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951775  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2559  phosphate transporter  65.13 
 
 
536 aa  632  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.768412  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4305  phosphate transporter  64.41 
 
 
528 aa  619  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.323368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3244  phosphate transporter  63.76 
 
 
528 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3432  phosphate transporter  63.44 
 
 
544 aa  616  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0245217  normal  0.231604 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1005  phosphate transporter family protein  62.33 
 
 
543 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4651  phosphate transporter  63.31 
 
 
530 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5180  phosphate transporter  63.12 
 
 
530 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.738193 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1572  phosphate transporter family protein  65.16 
 
 
494 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0613  phosphate transporter family protein  64.71 
 
 
528 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2208  phosphate transporter family protein  64.71 
 
 
528 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.757922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2121  phosphate transporter family protein  64.71 
 
 
528 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.990709  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2029  phosphate transporter family protein  64.71 
 
 
528 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0709  phosphate transporter family protein  64.71 
 
 
528 aa  609  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0807  phosphate transporter family protein  63.38 
 
 
528 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.65234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0357  phosphate transporter  63.12 
 
 
530 aa  600  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.763168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0970  phosphate transporter  62.7 
 
 
529 aa  591  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5327  phosphate transporter  60.56 
 
 
534 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4977  phosphate transporter  63.83 
 
 
530 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3076  phosphate transporter  63.64 
 
 
530 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5291  phosphate transporter  63.64 
 
 
530 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3178  phosphate transporter  60.11 
 
 
533 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0323756  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3469  phosphate transporter  60.11 
 
 
533 aa  578  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.866739 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3866  phosphate transporter  60.5 
 
 
542 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.860303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5255  phosphate transporter  60.19 
 
 
546 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4788  phosphate transporter  59.62 
 
 
546 aa  568  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.607928  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5331  phosphate transporter  58.67 
 
 
551 aa  555  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.899751  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1071  phosphate transporter  55.89 
 
 
497 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.454735  hitchhiker  0.000185026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4732  phosphate transporter  49.06 
 
 
473 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.84748  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4985  phosphate transporter  49.9 
 
 
473 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4312  phosphate transporter family protein  47.9 
 
 
490 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.388601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4016  phosphate transporter  47.9 
 
 
490 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10600  Phosphate transporter  49.39 
 
 
492 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55770  putative phosphate transporter  49.07 
 
 
489 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1262  phosphate transporter  48.76 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0927  phosphate transporter  44.93 
 
 
489 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.484963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0892  phosphate transporter  45.19 
 
 
489 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.170136  normal  0.621096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1373  phosphate transporter  48.95 
 
 
490 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.687008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4859  putative phosphate transporter  48.75 
 
 
489 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401236  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4441  phosphate transporter  48.95 
 
 
497 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375988  hitchhiker  0.000123098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4350  phosphate transporter  48.95 
 
 
497 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0115393 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3045  phosphate transporter  44.42 
 
 
489 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330688  normal  0.118917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3484  phosphate transporter  44.35 
 
 
489 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0878  phosphate transporter  44.35 
 
 
489 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3409  phosphate transporter  44.35 
 
 
494 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1052  low-affinity inorganic phosphate transporter  43.67 
 
 
489 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3607  phosphate transporter  44.14 
 
 
489 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.309683  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1013  phosphate transporter  49.16 
 
 
490 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000116864 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4203  phosphate transporter  44.08 
 
 
501 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4117  phosphate transporter  45.05 
 
 
502 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3020  phosphate transporter  45.34 
 
 
489 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4689  phosphate transporter  43.44 
 
 
500 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3907  phosphate transporter  43.88 
 
 
499 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4486  phosphate transporter  44.69 
 
 
501 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03342  phosphate transporter, low-affinity  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306207  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0222  phosphate transporter  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3782  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4033  low-affinity inorganic phosphate transporter  44.17 
 
 
498 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3930  phosphate transporter  42.4 
 
 
504 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0122  phosphate transporter  44.08 
 
 
531 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3692  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4839  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3975  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3829  low-affinity inorganic phosphate transporter 1  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0223  phosphate transporter  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03295  hypothetical protein  43.43 
 
 
499 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.335822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3782  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.43 
 
 
498 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.675569  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3963  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.43 
 
 
498 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4093  phosphate transporter  43.67 
 
 
498 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3859  putative low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.43 
 
 
498 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0686997  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3792  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.43 
 
 
498 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3902  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  43.43 
 
 
498 aa  371  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02863  phosphate transporter  42.56 
 
 
499 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485547  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3167  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  41.84 
 
 
499 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02812  hypothetical protein  42.56 
 
 
499 aa  364  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3454  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  41.84 
 
 
499 aa  364  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0706  phosphate transporter  42.56 
 
 
499 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.720208  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3272  low-affinity inorganic phosphate transporter 2  42.36 
 
 
499 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0709  phosphate transporter  42.36 
 
 
499 aa  362  9e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0055  low-affinity inorganic phosphate transporter  41.75 
 
 
524 aa  360  5e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2692  phosphate transporter  42.12 
 
 
451 aa  353  5e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.608667  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4299  probable low-affinity inorganic phosphate transporter 2  38.25 
 
 
438 aa  267  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0331  phosphate transporter  69.62 
 
 
160 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592641  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  39.74 
 
 
353 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0184  putative phosphate permease  41.05 
 
 
363 aa  134  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2385  phosphate transporter  34.95 
 
 
332 aa  133  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.15597  normal  0.883996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>