14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3257 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3257  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  237  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.272475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1263  hypothetical protein  56.38 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1165  hypothetical protein  57.61 
 
 		 98 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00139026  hitchhiker  1.4903800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1427  hypothetical protein  56.52 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000798357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1514  hypothetical protein  53.26 
 
 		 98 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2976  hypothetical protein  51.55 
 
 		 107 aa  93.6  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2461  hypothetical protein  47.25 
 
 		 97 aa  74.7  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1714  hypothetical protein  40 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1600  hypothetical protein  42.7 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0482  hypothetical protein  35.64 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000178511  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1901  hypothetical protein  38.54 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000992457  hitchhiker  0.00299873 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2612  hypothetical protein  36.47 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000688937 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0071  hypothetical protein  36.96 
 
 		 117 aa  50.8  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000941053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0563  hypothetical protein  30.85 
 
 		 146 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.256478  hitchhiker  0.00135384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>