15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2976 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2976  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  221  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1263  hypothetical protein  53.85 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1165  hypothetical protein  51.65 
 
 		 98 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00139026  hitchhiker  1.4903800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1427  hypothetical protein  52.27 
 
 		 96 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000798357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3257  hypothetical protein  51.55 
 
 		 115 aa  93.6  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.272475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1514  hypothetical protein  47.83 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1901  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000992457  hitchhiker  0.00299873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2461  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1600  hypothetical protein  35 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1714  hypothetical protein  32.97 
 
 		 436 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0482  hypothetical protein  33.71 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000178511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0071  hypothetical protein  32.26 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000941053  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2612  hypothetical protein  34.78 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000688937 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0563  hypothetical protein  32.22 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.256478  hitchhiker  0.00135384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0710  hypothetical protein  24.74 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>