15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1714 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1714  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  906    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000417514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1600  hypothetical protein  48.91 
 
 		 113 aa  97.8  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1901  hypothetical protein  46.15 
 
 		 120 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000992457  hitchhiker  0.00299873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2461  hypothetical protein  44.79 
 
 		 97 aa  90.1  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0071  hypothetical protein  47.19 
 
 		 117 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000941053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0482  hypothetical protein  45.74 
 
 		 129 aa  85.5  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000178511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3257  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.272475  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2612  hypothetical protein  40.22 
 
 		 114 aa  64.7  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000688937 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1263  hypothetical protein  37.11 
 
 		 114 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000376982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1427  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  61.2  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000798357  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1165  hypothetical protein  35.71 
 
 		 98 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00139026  hitchhiker  1.4903800000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1514  hypothetical protein  35.23 
 
 		 98 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2976  hypothetical protein  32.97 
 
 		 107 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1375  hypothetical protein  44.83 
 
 		 93 aa  46.2  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0970  hypothetical protein  32.47 
 
 		 84 aa  43.5  0.008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.875202  hitchhiker  0.00000000905134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>