22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2092 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
239 aa  487  1e-137  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0758  thiol peroxidase  42.02 
 
 
235 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1086  hypothetical protein  42.86 
 
 
237 aa  192  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
239 aa  186  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.145887  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1571  hypothetical protein  38.84 
 
 
236 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1382  hypothetical protein  38.84 
 
 
236 aa  165  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0584066  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1548  putative periplasmic protein  37.8 
 
 
246 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0271  hypothetical protein  38.43 
 
 
236 aa  149  3e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1288  hypothetical protein  36.2 
 
 
237 aa  143  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  29.81 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  30.39 
 
 
238 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  28.33 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  32.94 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  27.97 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  26.35 
 
 
253 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  25.4 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  35.94 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  35.94 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  35.82 
 
 
241 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  25.29 
 
 
250 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  33.9 
 
 
242 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>