27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1571 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1571  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1382  hypothetical protein  99.58 
 
 
236 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0584066  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0271  hypothetical protein  98.73 
 
 
236 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1288  hypothetical protein  52.77 
 
 
237 aa  238  4e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
239 aa  166  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1086  hypothetical protein  39.58 
 
 
237 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0758  thiol peroxidase  39.33 
 
 
235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0542  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
239 aa  132  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.145887  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1548  putative periplasmic protein  34.15 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.92 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.37 
 
 
286 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.37 
 
 
276 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.46 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.27 
 
 
241 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  24.84 
 
 
238 aa  46.2  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.3 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.92 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  24.68 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  24.68 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  24.69 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.27 
 
 
237 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.92 
 
 
252 aa  42  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2651  periplasmic thiol:disulfide interchange protein  28.57 
 
 
272 aa  42  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.381719  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0254  thiol:disulfide interchange protein  27.13 
 
 
285 aa  42  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000766083  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.92 
 
 
252 aa  42  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.32 
 
 
254 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4008  hypothetical protein  22.4 
 
 
298 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>