52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1184 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1184  Heterodisulfide reductase subunit B-like protein  100 
 
 
281 aa  565  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.910208  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1008  hypothetical protein  36.36 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.491762  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.09 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1028  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit C  23.53 
 
 
293 aa  75.5  0.0000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.288715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0403  hypothetical protein  29.93 
 
 
234 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1633  hypothetical protein  30.14 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0129  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  23.4 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.394033  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1452  hypothetical protein  30.14 
 
 
357 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2715  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.7 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.4 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4068  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.88 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0453  succinate dehydrogenase subunit C  25.44 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1993  succinate/fumarate oxidoreductase, putative  23.76 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1794  hypothetical protein  28.77 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.863459  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0175  succinate dehydrogenase subunit C  23.4 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.52 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.7 
 
 
282 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3648  succinate dehydrogenase subunit C  24.65 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115665  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.66 
 
 
297 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06200  heterodisulfide reductase, subunit B  24.12 
 
 
297 aa  62.4  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.860836  hitchhiker  0.00110828 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1881  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.9 
 
 
295 aa  62  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.983489  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3573  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.79 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0475  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.26 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2342  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.7 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0375  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.45 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.39 
 
 
297 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0772  hypothetical protein  31.75 
 
 
366 aa  59.3  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0150  CoB--CoM heterodisulfide reductase  30.12 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0862  CoB--CoM heterodisulfide reductase  28.45 
 
 
292 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3582  CoB--CoM heterodisulfide reductase  29.52 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0490  succinate dehydrogenase, C subunit  23.27 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1632  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.22 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3425  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  27.62 
 
 
296 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1516  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  23.67 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.479226  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0432  CoB--CoM heterodisulfide reductase  24.03 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0465  succinate dehydrogenase, C subunit  22.86 
 
 
285 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2240  CoB/CoM heterodisulfide reductase, subunit B  21.92 
 
 
296 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.145621  normal  0.0183025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0091  heterodisulfide reductase subunit  26.7 
 
 
296 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1837  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  22.03 
 
 
296 aa  52.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.213828  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0403  CoB--CoM heterodisulfide reductase  22.61 
 
 
300 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26920  heterodisulfide reductase, subunit B  21.01 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1043  hypothetical protein  39.19 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.838471  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1605  CoB--CoM heterodisulfide reductase, subunit B  21.03 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.590604  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0540  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit B  21.03 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0307  CoB--CoM heterodisulfide reductase  21.03 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0810  hypothetical protein  24.23 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000756552 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0310  succinate dehydrogenase subunit C  20.64 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.231375 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1645  heterodisulfide reductase, B subunit  21 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0422083  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0376  CoB--CoM heterodisulfide reductase  20.9 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1281  hypothetical protein  20.58 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0395  CoB--CoM heterodisulfide reductase  19.46 
 
 
462 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1208  succinate dehydrogenase subunit C  28.57 
 
 
299 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>