14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0403 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0403  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1452  hypothetical protein  48.89 
 
 
357 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1633  hypothetical protein  48.15 
 
 
357 aa  112  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1794  hypothetical protein  48.15 
 
 
357 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.863459  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1008  hypothetical protein  37.88 
 
 
338 aa  90.1  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.491762  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0772  hypothetical protein  34.55 
 
 
366 aa  89.7  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1043  hypothetical protein  42.86 
 
 
339 aa  88.6  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.838471  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1184  Heterodisulfide reductase subunit B-like protein  29.93 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.910208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  27.93 
 
 
304 aa  48.9  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2945  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3151  CoB--CoM heterodisulfide reductase  31 
 
 
297 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00144336  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0286  CoB--CoM heterodisulfide reductase  23.2 
 
 
282 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.82153  normal  0.840113 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0250  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.77 
 
 
282 aa  46.2  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26914  normal  0.65671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2526  CoB--CoM heterodisulfide reductase  25.23 
 
 
302 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>