20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3406 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3406  histidine kinase  100 
 
 		 83 aa  170  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2751  hypothetical protein  50 
 
 		 86 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575251  normal  0.46355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1829  hypothetical protein  51.28 
 
 		 86 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00321962  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1736  hypothetical protein  48.72 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1887  hypothetical protein  47.44 
 
 		 86 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.768995 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2309  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2714  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2379  hypothetical protein  44.87 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2499  hypothetical protein  44.87 
 
 		 86 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.514847  hitchhiker  0.00312336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2483  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00627198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1842  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1795  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1661  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0317359  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1803  hypothetical protein  46.15 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1527  hypothetical protein  43.59 
 
 		 86 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.911126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1452  hypothetical protein  42.31 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1345  hypothetical protein  39.74 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2320  hypothetical protein  40.79 
 
 		 98 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.957769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1018  hypothetical protein  41.03 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.473242  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02804  hypothetical protein  35.53 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>