23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1842 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2483  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00627198  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1842  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1795  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1803  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1661  hypothetical protein  97.67 
 
 
86 aa  181  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0317359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2714  hypothetical protein  94.19 
 
 
86 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2379  hypothetical protein  93.02 
 
 
86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.200135  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2499  hypothetical protein  93.02 
 
 
86 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.514847  hitchhiker  0.00312336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2309  hypothetical protein  91.86 
 
 
86 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137497  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1527  hypothetical protein  88.37 
 
 
86 aa  167  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.911126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2751  hypothetical protein  83.72 
 
 
86 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575251  normal  0.46355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1887  hypothetical protein  82.56 
 
 
86 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.768995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1736  hypothetical protein  81.4 
 
 
86 aa  154  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1829  hypothetical protein  82.56 
 
 
86 aa  153  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00321962  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1452  hypothetical protein  80.23 
 
 
87 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774071  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2320  hypothetical protein  73.26 
 
 
98 aa  143  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.957769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1345  hypothetical protein  56.96 
 
 
85 aa  104  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242524  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3406  histidine kinase  46.15 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0066  hypothetical protein  39.08 
 
 
88 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02804  hypothetical protein  44.74 
 
 
87 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2065  hypothetical protein  33.72 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1018  hypothetical protein  34.18 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.473242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1090  hypothetical protein  29.11 
 
 
86 aa  44.3  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0569647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>