24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1345 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1345  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  178  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.242524  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2483  hypothetical protein  56.96 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00627198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1842  hypothetical protein  56.96 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0162568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1795  hypothetical protein  56.96 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1803  hypothetical protein  56.96 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1661  hypothetical protein  56.96 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0317359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1527  hypothetical protein  55.7 
 
 		 86 aa  100  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.911126  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2714  hypothetical protein  55.7 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2499  hypothetical protein  55.7 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.514847  hitchhiker  0.00312336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2379  hypothetical protein  55.7 
 
 		 86 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.200135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2309  hypothetical protein  54.43 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1452  hypothetical protein  54.43 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.774071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2320  hypothetical protein  56.58 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.957769  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02804  hypothetical protein  57.83 
 
 		 87 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.261538  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1829  hypothetical protein  50.63 
 
 		 86 aa  90.1  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00321962  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2751  hypothetical protein  49.37 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575251  normal  0.46355 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1887  hypothetical protein  48.1 
 
 		 86 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.81212  normal  0.768995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1736  hypothetical protein  48.1 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0066  hypothetical protein  48.78 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3406  histidine kinase  39.74 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.123813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2065  hypothetical protein  36.25 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1018  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.473242  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1090  hypothetical protein  32.5 
 
 		 86 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0569647  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01550  hypothetical protein  31.25 
 
 		 86 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>