14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1785 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1785  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2141  hypothetical protein  47.44 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.582922  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3601  hypothetical protein  47.44 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00263204  normal  0.496996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1681  hypothetical protein  47.44 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.703863  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1657  hypothetical protein  47.44 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25140  hypothetical protein  43.42 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2005  hypothetical protein  38.64 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.238929  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1585  hypothetical protein  40.91 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.681662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14490  hypothetical protein  48.53 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3512  hypothetical protein  45.45 
 
 		 87 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3285  hypothetical protein  42.25 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3874  hypothetical protein  39.47 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.415735  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1562  hypothetical protein  45 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82883  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2150  hypothetical protein  42.65 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>