13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2150 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2150  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25140  hypothetical protein  98.51 
 
 
77 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1585  hypothetical protein  77.94 
 
 
78 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.681662 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2141  hypothetical protein  79.1 
 
 
77 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.582922  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3512  hypothetical protein  79.1 
 
 
87 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3285  hypothetical protein  79.1 
 
 
77 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54392  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3601  hypothetical protein  79.1 
 
 
77 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00263204  normal  0.496996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1681  hypothetical protein  79.1 
 
 
77 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.703863  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1657  hypothetical protein  79.1 
 
 
77 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191309  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14490  hypothetical protein  77.61 
 
 
77 aa  107  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3874  hypothetical protein  76.12 
 
 
77 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.415735  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1785  hypothetical protein  42.65 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416073  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2005  hypothetical protein  40.62 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.238929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>