15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25140 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25140  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  156  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2150  hypothetical protein  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1585  hypothetical protein  80.77 
 
 
78 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.681662 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3512  hypothetical protein  80.52 
 
 
87 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14490  hypothetical protein  80.52 
 
 
77 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3285  hypothetical protein  80.52 
 
 
77 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54392  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3874  hypothetical protein  79.22 
 
 
77 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.415735  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2141  hypothetical protein  80.52 
 
 
77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.582922  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3601  hypothetical protein  80.52 
 
 
77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00263204  normal  0.496996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1681  hypothetical protein  80.52 
 
 
77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.703863  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1657  hypothetical protein  80.52 
 
 
77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191309  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1785  hypothetical protein  43.42 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416073  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2005  hypothetical protein  43.24 
 
 
86 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.238929  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2116  hypothetical protein  35.23 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2237  hitchhiker  0.000000248115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1562  hypothetical protein  40.62 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>