14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1463 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1463  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1802  hypothetical protein  52.88 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4626  hypothetical protein  55.8 
 
 		 194 aa  204  6e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4110  hypothetical protein  48.42 
 
 		 198 aa  194  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.932405  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2533  hypothetical protein  48.65 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.897516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2784  hypothetical protein  48.7 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000283407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0634  hypothetical protein  48.42 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2342  hypothetical protein  52.13 
 
 		 198 aa  182  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.387006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0111  hypothetical protein  49.48 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3535  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 205 aa  168  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10460  conserved hypothetical protein  43.43 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.153983  normal  0.153126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0157  hypothetical protein  41.4 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2333  hypothetical protein  45 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0970  hypothetical protein  39.18 
 
 		 201 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>