14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4110 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4110  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.932405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1463  glutamyl-tRNA synthetase  48.42 
 
 		 194 aa  194  6e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2533  hypothetical protein  41.75 
 
 		 196 aa  167  9e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.897516  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1802  hypothetical protein  39.59 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3535  glutamyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 		 205 aa  157  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0634  hypothetical protein  38.19 
 
 		 199 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10460  conserved hypothetical protein  40.2 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.153983  normal  0.153126 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2342  hypothetical protein  37.69 
 
 		 198 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.723886  normal  0.387006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0111  hypothetical protein  38.34 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2784  hypothetical protein  36.63 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000283407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0157  hypothetical protein  33.68 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4626  hypothetical protein  39.18 
 
 		 194 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2333  hypothetical protein  37.28 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0691639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0970  hypothetical protein  34.59 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199234 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>